Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms