Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DenrQ9CQJ6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms