Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms