Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StambpQ9CQ26 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
StambpQ9CQ26 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms