Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms