Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q99KU6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q99KU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99KU6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99KU6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99KU6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms