Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms