Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dok4Q99KE3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms