Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg13Q91YI1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg13Q91YI1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms