Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms