Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms