Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms