Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q6

Neil1, Endonuclease 8-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil1Q8K4Q6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms