Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms