Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms