Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DseQ8BLI4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms