Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ttc29Q80VM3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc29Q80VM3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc29Q80VM3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc29Q80VM3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc29Q80VM3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc29Q80VM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc29Q80VM3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc29Q80VM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc29Q80VM3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc29Q80VM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttc29Q80VM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ttc29Q80VM3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc29Q80VM3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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