Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LnpkQ7TQ95 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms