Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms