Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc4Q6S5L9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms