Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms