Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms