Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms