Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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