Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw2Q6I6G8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw2Q6I6G8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw2Q6I6G8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms