Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6GQU0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6GQU0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6GQU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6GQU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6GQU0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6GQU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6GQU0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6GQU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6GQU0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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