Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms