Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms