Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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