Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms