Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms