Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms