Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms