Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms