Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms