Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap44Q5SSM3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms