Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim58Q5NCC9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms