Protein–RNA interactions for Protein: Q5F226

Fat2, Protocadherin Fat 2, mousemouse

Predictions only

Length 4,351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fat2Q5F226 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fat2Q5F226 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fat2Q5F226 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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