Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl5Q5DTT4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms