Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms