Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srek1ip1Q4V9W2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms