Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms