Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam220aQ3ZN08 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms