Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933416C03RikQ3V063 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933416C03RikQ3V063 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933416C03RikQ3V063 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933416C03RikQ3V063 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933416C03RikQ3V063 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933416C03RikQ3V063 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms