Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc27Q3V036 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms