Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms