Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms