Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Znf48Q3US17 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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