Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpr55Q3UJF0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms