Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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